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1) Biblioteca: Emplazada en la planta baja ala norte, grandes ventanales dan vista al paisaje del parque Mariano Moreno. La biblioteca esta dividida en partes dispuesta en peine con un pasillo hacia el sur del edificio de la siguiente manera: a) Medicina, b)Ciencias Sociales e Historia, c) Ciencias Biológicas, Agricultura y Ganadería, d) Ciencias Naturales y Ciencias de la Educación, e) Unidad Atención al Publico, f) Sala de Lectura, g) Al costado derecho del pasillo: La disposición del material es de acuerdo a lo siguiente: - Publicaciones del Museo - Medicina - Geología - Paleontología - Geografía - Física - Matemática - Antropología 2) Laboratorio Fotográfico: Allí se encuentran fotografías, negativos y fotogramas en blanco y negro. Se realizan tomas en blanco y negro, ampliaciones reducciones y revelado de negativos 3) Planoteca y Mapoteca: Se encuentran aproximadamente 500 planos. En esta sección hay además diversas cartografías y relevamientos de tierras, referentes a la región de Río Atuel y Diamante. 4) Diapoteca: Aquí se encuentras las diapositivas clasificadas por temas, las mismas están encarpetadas. 5) Videoteca y Fonoteca: Posee cientos de casetes y grabaciones referentes a congresos, viajes y exploraciones realizadas por el equipo de Antropología de Museo y otras valiosas colecciones bibliográficas. 6) Hemeroteca: Se encuentra en esta sección revistas, colecciones periódicas de actualidad y diario. 7) Servicio Educativo y Asuntos Académicos: Formados por el aula, y la sala de conferencias, sala de lecturas, material didáctico, visitas guiadas y programas educativos. 8) Imprenta y encuadernación. Área Departamentos Técnicos y Científicos.
1) Botánica: a cargo de la profesora Alicia Hernández, este departamento cuenta con un herbario de alrededor de 10000 muestras regionales y exóticas, y diversas drogas de origen vegetal, donde se realizan tareas de investigación orientadas a la determinación taxonómica, utilidad y características de aplicación en vegetales actuales y arqueológicos. Estas tareas complementan a los departamentos de antropología, por ejemplo analizando como las sociedades prehispánicas utilizan los recursos vegetales. 2) Zoología: a cargo de la profesora Flavia Lagiglia y de su auxiliar Norma Bellido. Aquí se realiza el trabajo de taxidermia (embalsamamiento) y todo un relevamiento e intercambio de las especies de otros lugares. Parte de la Biología que estudia los animales, su morfología, su comportamiento, y ambiente. En este laboratorio se realiza el proceso de taxidermia que permite conservar la estructura externa de los animales, su apariencia. También se determinan especies regionales y mantiene un amplio archivo de pieles, huesos, huevos, y animales conservados en formol o taxidermizados. Esta área permite tener referencias de la fauna local, para que investigadores realicen valiosos aportes al conocimiento de los seres con quienes compartimos nuestro medio. 3) Sala de flora y fauna: se realiza el trabajo de taxidermia (ordenamiento de la piel). Se tiene un convenio con el zoológico de Mendoza y con el de San Rafael de donde los animales son traídos cuando mueren accidentalmente o por muerte natural en cautiverio, también con zoológicos privados o con personas que donan sus mascotas una vez muertas. A demás hay un intercambio con otras instituciones ya que nosotros tenemos una zona de ornitología y otros nos donan pájaros provenientes de la zona del litoral. 4) Paleontología: Consta de importantes colecciones de fósiles de las eras Paleozoicas, Mesozoicas y del Cenozoico. Que sirven de apoyo a investigadores del país y del extranjero. Posee troncos de araucarias petrificados con amonites procedentes del periodo triásico de 280 millones de años procedentes de la zona cordillerana Las Leñas; este tipo de fósil esta a largo y ancho de la cordillera. También hay fósiles de antes del plegamiento de Los Andes. Lo cual era una zona lacustre, cálida, de grandes bosque y de gran actividad volcánica hasta hace 65 millones de años en la parte sur de la provincia donde hoy es el bloque exhumado de San Rafael, o Sierra Pintada, lo que hoy se conoce como Villa 25 de Mayo, Los Reyunos, El Nihuil, Valle Grande, Cañón del Atuel, hasta el Cerro El Nevado, eso era la playa de un mar que nos unía con el Océano Pacifico, es por eso que hoy encontramos fósiles marinos. Cuando se produce el plegamiento de Los Andes, ese movimiento quiebra esa planicie, esa playa y lo extrae, todos los periodos geológicos estratificados en la planicie que hoy es el Monte Argentino. Pasado el tiempo quedo un lago interior, después se produce una pequeña era glaciar y por fin se evaporo el agua de ese mar, levantando el murallón que es la Cordillera de Los Andes, impidiendo el paso del aire húmedo del océano Pacifico, cambiando así el clima, el suelo y es por eso que nuestra zona desértica, semiárida que forman tres grandes provincias argentinas, encuadra a Mendoza en tres grandes zonas fitozoogeograficas que son: la parte oriental, el Monte Argentino, la parte occidental, es el desierto Alto Andino con características de la Puna, y parte de Malargüe, esto comprendería la estepa Patagónica; entonces toda la flora y la fauna nuestra corresponde a las características de las tres zonas.
5) Geología: a cargo del Licenciado Dieres, estudia la composición del suelo. Vivimos en una zona sísmica de mucha actividad volcánica de diferentes eras geológicas y pertenecemos al Cinturón de Fuego del Océano Pacífico. Estudia la composición de la corteza terrestre, su naturaleza, distribución, génesis y evolución. En este laboratorio se estudian las rocas, minerales, sedimentos y todos aquellos elementos que componen la corteza terrestre. Se cuenta con una valiosa colección de minerales (preciosos y semipreciosos), rocas (ígneas, metamórficas y sedimentarias) utilizadas por investigadores locales y extranjeros, para el estudio de la composición y comportamiento de las formaciones geológicas regionales. 6) Astronomía: a cargo de Andrés Risi , Ciencia que estudia el universo (los astros, planetas, estrellas, satélites, galaxias, cometas, etc.), su composición y evolución, así como las leyes que lo rigen. En este laboratorio se realizan actividades coordinadas con observatorios astronómicos de otras partes del Mundo, en temas como estrellas variantes, descubrimientos de nuevos Cuerpos celestes, medición de intensidad de las estrellas, etc. 7) Antropología: Ciencia que estudia la Historia y Prehistoria del hombre a través de los vestigios materiales (ruinas, monumentos, utensilios, arte, etc. En este laboratorio se trabaja con todos aquellos restos materiales de culturas regionales que han sido descubiertos mediante excavaciones sistemáticas. A este departamento llegan gran cantidad de investigadores de todas partes del Mundo para trabajar y asesorarse de los avances científicos que se desarrollan. 8) Bioantropología: a cargo de la Doctora Paula Novellino, Ciencia que investiga los rasgos físicos mediante estudios anátomo-fisiológicos. En este laboratorio se realizan estudios de los restos óseos humanos encontrados, generalmente en antiguos cementerios indígenas. Se puede determinar sexo, edad aproximada, tipo de alimentación, vestigios patológicos y de accidentes, que les permite a los antropólogos establecer parámetros culturales y biológicos. 9) Biología: a cargo del Licenciado Ricardo Juárez y Cristian Carrión. 10) Arqueología: ha cambiado la historia a partir de un descubrimiento que se realizó en 1959 del Club Científico Amigos de la Naturaleza, que fue el descubrimiento de la momia, esto fue lo que revolucionó a la historia, ya que nosotros conocíamos nuestra historia a partir de lo que encontrón los conquistadores españoles cuando llegaron a América, si venimos a Mendoza estamos hablando del Huarpe, del Puelche Algarrobedo, del Pehuenche y Mapuche, pero cuando el equipo arqueológico encuentra objetos prehistóricos cambiando por tal motivo nuestra historia, tenemos elementos líticos que son los primeros de 14.000 años de antigüedad, entonces estamos hablando de una historia en el sur mendocino que pasa por etapa de primeros habitantes, dividiéndose en etapas prehistórica, arqueológica e histórica. La Etapa Prehistórica tiene a la altura de Los Corrales I y II de 14.000 años de antigüedad, 8 mil y 10.000 de antigüedad Edad Media de Piedra Tallada, luego se encuentran las culturas del Atuel que se ubican en la zona de la Cueva del Indio, esta cultura data de 10.000 años de antigüedad.
La Cultura del Atuel II, con 2.200 años de antigüedad, son los primeros agricultores de San Rafael en el Distrito de Rama Caída y son los primeros en utilizar el sistema de regadío. Cultivaban el maíz, el zapallo y el poroto. Luego pasamos a las culturas arqueológicas de Mendoza que son aquellas que nos hacen enlace entre las prehistóricas y las históricas. En Mendoza tenemos la Cultura de Agrelo en el Norte que son agroalfareros que van desde el 0 al 1200 d.C. Cuando esta recibe la influencia del inca para ser la cultura de Viluco que se nota a través de su alfarería la influencia Inca, y esta da paso a los Huarpes. Cultura del Overo Arqueológica Con un asentamiento llamado El Indígena a 3.8000 metros sobre el nivel del mar, al pie del Volcán Overo, en el nacimiento del Río Atuel, en un valle donde hay un microclima especial, donde hay agua dándose buenas pasturas, en este lugar hay un asentamiento indígena que da paso a los Puelches Algarrobenos de Cuyo, son los autóctonos del sur mendocino. Otras culturas históricas de primeros habitantes que serían lo Mapuches y Pehuenches, que dan lugar a la Fundación de San Rafael del Diamante de la cual se encuentra una muestra de elementos del Fortín de San Rafael. 11) Física y Química. Todos los Departamentos Técnicos son muy prolíferos, formando un gran equipo realizando diversas actividades como exploración, investigación, rescate, conclusión y producción de conocimientos científicos. El Museo cuenta con el Área de Documentación y de Informática que está compuesta por una biblioteca la cual esta a cargo de la profesora Diana Olmedo y su Auxiliar. Dentro de esta área también tenemos el parea de encuadernación, imprenta, archivo histórico, fotografía, servicio educativo, mapoteca, hemeroteca, plano teca y hay una serie de elementos que se están trabajando, como así también muchísimo patrimonio que poco a poco se va organizando y ordenando lo cual sería documentado e informatizado. Área de Servicios y Mantenimiento.
En total en el edificio trabajan 35 empleados. Área de Investigación.La estructura y los equipos de investigación con lo que hoy cuenta el museo, y sus colecciones, sirven de base para la actividad científica y la divulgación del conocimiento. Desde su origen a mediados de la década del cincuenta, estos han sido objetivos centrales en la actividad de la Institución, y desde entonces los aportes han ido ganando espacio en la orbita provincial y nacional.El Museo ha sido sede organizadora de encuentros de investigadores de todo el mundo exponiendo trabajos a sus pares. Se han realizado dos Congresos Nacionales de Arqueología Argentina(1976 y 1994), la Reunión del Proyecto PICA-242 y 245 (UNESCO), Progresos en la bioes. Además, el Museo cuenta con varios proyectos, colaborando en investigaciones de diferentes museos y universidades. Investigadores de nuestro país y del extranjero emplean la estructura de la institución para sus trabajos de campo en la región. Todo esto muestra la envergadura de la Institución en la investigación científica nacional e internacional.
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